Partiel Biochimie Structurale – 2011 – N°1

Thèmes :

Questions de cours : NTP / dNTP / ddNTP / Niveau structural / Acide faible / pKa / Forme acide / Forme conjuguée / Liaison hydrogène / Acide aminé

Applications : Ion hydroxyle / ADN / Double hélice / Adénine / Guanine / Thymine / Cytosine / Brin / Electrophorèse / Agarose / Solution tampon / Histone / Protéine / Noyau / Organite / Lysine / Arginine / Soude / NaOH

Extrait :

Questions de cours
1 . Quelles sont les fonctions biologiques des NTP, dNTP et ddNTP ? Qu’est ce qui les différencie au niveau structural ? (2 points)
2 . Si un acide faible présente un pKa = 3,5, quelle sera le rapport entre la forme acide et la base conjuguée à pH = 4,5. (2 points)
3 . Dans une molécule d’eau, combien y a-t-il de liaison(s) hydrogène possible(s). Faites un schéma. (2 points)
4 . Entre les deux acides aminés ci-dessous, lequel est le plus soluble dans l’eau ? Pourquoi ? Nommer chacun de ces acides aminés. (3 points)
5 . Quelle est la concentration en ions hydroxyl (OH-) d’une solution dont le pH = 12 ? (2 points)
6 . La composition de l’une des chaînes d’ADN en double hélice d’un organisme est de 30% d’adénine et 24 % de guanine. Que pouvez-vous dire de la composition en thymine et cytosine du même brin ? Que pouvez-vous dire de la composition en A,T,C et G du brin complémentaire ? (3 points)
7 . Expliquez pourquoi et comment l’ADN se déplace lors d’une électrophorèse sur gel d’agarose dans une solution tampon à pH = 7. (2 points)
8 . Les histones sont des protéines localisées dans le noyau qui servent à enrouler l’ADN de manière à ce que cette molécule de plusieurs centimètres de long tienne dans un organite de 1 µm de diamètre. Pourquoi ces protéines sont enrichies en lysine et arginine ? Comment cet enrichissement peut servir la fonction de la protéine ? (2 points)
9 . Quelle va être l’action de la soude (NaOH) sur les guanines, schématisées ci-dessous à pH = 7 ? Quelles seront les conséquences sur la double hélice d’ADN ? (2 points)

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